孙某是某医疗机构具备麻醉药品和第一类精神药品处方资格的执业医师，其在诊疗中未按照临床应用指导原则的要求使用麻醉药品，按照我国《麻醉药品和精神药品管理条例》的规定，医疗机构应对孙某进行的处理措施是()*A. 警告B. 罚款C. 暂定执业活动D. 取消其麻醉药品和第一类精神药品处方资格E. 吊销其执业证书

步骤 1：理解背景信息
根据《麻醉药品和精神药品管理条例》的规定，医疗机构的执业医师在诊疗中使用麻醉药品和第一类精神药品时，必须遵循临床应用指导原则。如果执业医师未按照这些指导原则使用麻醉药品，医疗机构有权采取相应的处理措施。

步骤 2：分析处理措施
根据《麻醉药品和精神药品管理条例》的规定，如果执业医师未按照临床应用指导原则的要求使用麻醉药品，医疗机构可以采取的处理措施包括警告、罚款、暂定执业活动、取消其麻醉药品和第一类精神药品处方资格等。其中，取消其麻醉药品和第一类精神药品处方资格是最直接针对违规行为的处理措施。

步骤 3：确定最终答案
根据上述分析，医疗机构应对孙某进行的处理措施是取消其麻醉药品和第一类精神药品处方资格。